O Instituto Geológico possui 4 Centros com Núcleos de Pesquisa Científica: Centro de Geologia e Meio Ambiente, Centro de Estudos Geográficos da Paisagem, Museu Geológico e Centro de Atividades Tecnológicas. O quadro de servidores efetivos inclui 50 pesquisadores científicos, sendo 31 doutores, 8 mestres, 3 com especialização ou graduação e 8 vagos, além de 22 assistentes de apoio à pesquisa com graduação.